香港居民企業轉讓境內公司股權是否需要代扣代繳所得稅，是一個涉及稅法規定和實際操作的復雜問題。以下是對此問題的詳細解答：

一、稅法規定
企業所得稅：

根據《中華人民共和國企業所得稅法》及其實施條例，非居民企業（包括香港居民企業）轉讓其在境內公司持有的股權，取得的轉讓所得應在中國境內繳納企業所得稅。通常情況下，稅率為10%。
該所得稅由受讓方代扣代繳，并在其所在地主管稅務機關申報繳納。
避免雙重征稅協定：

香港與內地之間簽訂了避免雙重征稅的協定，該協定規定了雙方在稅收方面的權利和義務。根據協定，香港居民企業在內地取得的股權轉讓所得，在符合一定條件下，可以在香港申請稅收抵免，以避免雙重征稅。
二、實際操作
代扣代繳：

在實際操作中，當香港居民企業轉讓境內公司股權時，受讓方需要按照稅法規定代扣代繳企業所得稅。這要求受讓方了解相關稅法規定，并在交易過程中確保稅款的正確計算和繳納。
稅務籌劃：

香港居民企業在轉讓境內公司股權前，可以進行稅務籌劃，以優化稅務結構并降低稅負。這包括了解并利用避免雙重征稅協定的規定、合理安排交易結構等。
注意事項：

在進行股權轉讓交易時，雙方應確保交易的真實性和合法性，避免通過虛假交易等手段逃避稅收。
同時，雙方還應關注稅務政策的最新動態，以便及時調整交易策略和稅務籌劃方案。
三、特殊情況
如果香港居民企業在轉讓股權前曾經直接或間接擁有被轉讓公司25%以上的股份，或者該公司在轉讓前三年內的賬面資產中有50%以上為不動產，內地稅務機關可能根據相關規定行使征稅權。
在這種情況下，香港居民企業需要更加關注內地稅法的規定和實際操作要求，以確保稅款的正確計算和繳納。
綜上所述，香港居民企業轉讓境內公司股權需要代扣代繳所得稅。雙方在進行交易時應嚴格遵守稅法規定和相關政策要求，確保交易的合法性和稅務處理的準確性。同時，雙方還可以關注避免雙重征稅協定的規定和稅務籌劃的可能性，以優化稅務結構并降低稅負。